
تقدم هذه الدورة منهجًا متقدمًا لتحليل بيانات تسلسل الرنا RNA من منظور حيوي معلوماتي، يشمل بيانات القراءة القصيرة والطويلة باستخدام تقنيات مثل RNA-seq وPacBio وONT. يركز المساق على الأسئلة الأساسية في علم التعبير الجيني مثل: ما هي الجينات والنصوص المعبر عنها؟ ما هي مستويات التعبير؟ وما هي الفوارق في أنماط التعبير والتجزئة بين العينات أو التجارب المختلفة؟ يوفر المساق تعليمًا عمليًا في استخدام أدوات برمجية شهيرة تشمل STAR، PsiCLASS، DESeq2، rMATS، MntJULiP، Minimap2 وIsoQuant، بالإضافة إلى تطبيقات في بيئة نظام تشغيل شبيهة بـ Unix. تستهدف الدورة المتعلمين الذين لديهم معرفة أساسية باستخدام أدوات سطر الأوامر الحيوية المعلوماتية.
Liliana Florea, PhD
Associate Professor