عن الدورة
أصبحت مبادئ وتقنيات البحث القابل لإعادة الإنتاج اليوم أكثر أهمية من أي وقت مضى عبر تخصصات متنوعة تمتد من الفيزياء الفلكية إلى العلوم السياسية. فلا أحد يرغب في إجراء بحث لا يمكن إعادة إنتاجه أو التحقق منه. لذلك صُمّم هذا المقرر لكل من يعمل على أبحاث كثيفة البيانات، وليس لفئة محددة بعينها. ورغم أن كثيرًا من المشاركين قد يأتون من خلفيات في العلوم الحيوية والطب الحيوي، فإن هذا المقرر موجّه لجمهور واسع من علماء البيانات والباحثين في مختلف المجالات. واستجابةً لاحتياجات المجتمع العلمي، يستعرض المقرر الأسس الجوهرية للمنهجيات والأدوات التي تدعم البحث القابل لإعادة الإنتاج. بقيادة أعضاء هيئة تدريس ذوي خبرة من كلية هارفارد تي. إتش. تشان للصحة العامة، ستشارك في ست وحدات تعليمية تتضمن عدة دراسات حالة توضّح الأثر الكبير لتطبيق أساليب البحث القابل لإعادة الإنتاج على الاكتشاف العلمي. ستتعرف على كيفية تنظيم العمل البحثي، وتوثيق مصادر البيانات ومسارها، وبناء تصميم تجريبي يمكن تكراره، إضافةً إلى استخدام أدوات حاسوبية وإحصائية تساعدك على إعادة تنفيذ التحليلات بثقة، ومشاركة النتائج مع الآخرين بطريقة واضحة وقابلة للتحقق.
ماذا ستتعلم
- فهم مجموعة من المفاهيم وأنماط التفكير ونماذج التحليل والأدوات الحاسوبية والإحصائية التي تدعم علم البيانات والبحث القابل لإعادة الإنتاج
- إتقان أساسيات العلم القابل لإعادة الإنتاج عبر دراسات حالة تُظهر ممارسات متنوعة
- التعرّف على العناصر الأساسية لضمان مصدرية البيانات (Data Provenance) وتصميم تجارب قابل لإعادة الإنتاج
- تطبيق أساليب إحصائية تدعم تحليل بيانات قابل لإعادة الإنتاج
- استخدام أدوات حاسوبية لإعادة إنتاج تحليل البيانات والتحكم بالإصدارات مثل Git/GitHub، وأدوات التطوير (Emacs/RStudio/Spyder)، ومستودعات البيانات (Data repositories/Dataverse)، وإنشاء تقارير ديناميكية قابلة لإعادة الإنتاج (Rmarkdown/R Notebook/Jupyter/Pandoc) وسير العمل
- تعلّم كيفية تطوير أساليب وأدوات جديدة للبحث القابل لإعادة الإنتاج وإعداد التقارير
المتطلبات المسبقة
- معرفة أساسية بلغة R وGit
- حاسوب قادر على تنزيل وتشغيل البرمجيات اللازمة
المدرسون
Curtis Huttenhower
Associate Professor of Computational Biology and Bioinformatics
John Quackenbush
Professor of Computational Biology and Bioinformatics
Lorenzo Trippa
Associate Professor of Biostatistics
Christine Choirat
Research Associate